Der SV Wehen Wiesbaden wurde bereits im Jahr 1926 gegründet. Nach Ende des Zweiten Weltkriegs folge eine Neugründung und der SV konnte in der B-Klasse weiterspielen. Schon 1957 gelang dem SV Wiesbaden der erste Meistertitel und brillierte die zwei folgenden Jahre immerhin als Vizemeister. Im Jahr 1960 gewann der SV Wehen Wiesbaden den Kreis- und Bezirkspokal, bevor sie fünf Jahre später den Aufstieg in die A-Klasse bewerkstelligten. Die Teilnahme an der Bezirksliga 1968 dauerte drei Jahre, bevor sich der Verein 1971 wieder in die A-Klasse verabschieden musste. Ein erneuter Aufstieg gelang der Mannschaft erst 1983 und im Jahr 1987 konnte der SV Wehen Wiesbaden schließlich das erste Mal in die Landesliga aufsteigen.
Nur zwei Jahre später gewann der Verein die Meisterschaft und durfte in die Oberliga aufsteigen. Nach der Teilnahme am DFB Pokal zwischen den Jahren 1992 und 1994 gelang dem SV Wehen Wiesbaden 1996 ein weiterer Aufstieg in die Regionalliga. Der Verein schlug sich in der Regionalliga Süd in den folgenden Jahren gut und verpasste 2005 nur knapp den Aufstieg in die 2. Bundesliga. Erst in der Saison 2006/07 sollte dem SW Wehen Wiesbaden der erste Aufstieg in die 2. Bundesliga gelingen.
Da das frühere Stadion des Vereins den Anforderungen der DFL nicht genügte, entschloss man sich für einen Neubau: die Brita Arena in Wiesbaden. Erst seit der Umsiedelung nach Wiesbaden nennt sich der Verein SV Wehen Wiesbaden. Bis zur Fertigstellung des Stadions spielte der SV Wehen Wiesbaden in der Commerzbank Arena. Der neue Standort brachte dem Verein Glück und sie starteten erfolgreich in ihre erste Zweitligasaison. Die Ernüchterung kam, als sie schließlich die Brita Arena bezogen, der Verein konnte sich jedoch auf einem einstelligen Tabellenplatz retten.
Die Saison 2008/09 begann schlecht für den SV Wehen Wiesbaden und Trainer Christian Hock wurde entlassen. Weitere Trainerwechsel folgten, ein Abstieg in die 3. Liga konnte dadurch jedoch nicht mehr verhindert werden. Im DFB Pokal lief es in dieser Saison besser für den Verein, da sie immerhin den Weg ins Viertelfinale schafften.
Die Saison in der 3. Liga 2009/10 startete sehr schwach, den Klassenerhalt konnte die Mannschaft am Ende doch noch bewerkstelligen. In der folgenden Saison spiele Gino Lettieris Mannschaft stark und verpasste nur knapp die Relegation. Im Juli 2011 konnte der SV Wehen Wiesbaden in einem DFB Pokalspiel zeigen, was in ihnen steckt, allerdings verpassten sie knapp den Einzug in die 2. Runde. Die Saison 2011/12 begann für den SV Wehen Wiesbaden zufriedenstellend.
